乡镇政府一般无权直接出具加层许可证明，需遵循城乡规划法。
分析：根据《城乡规划法》，国有土地上建筑物的加层需符合城乡规划要求，并经过相关部门的审批。乡镇政府通常不具备城乡规划审批权，因此不能直接出具加层许可证明。您应向县级以上城乡规划主管部门提出申请，并按照法定程序进行审批。
提醒：若未经批准擅自加层，可能面临行政处罚，如罚款、责令拆除等。问题严重时，应及时寻求专业法律顾问的帮助。
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具体操作：
1. **申请加层审批**：准备国有土地使用证、房产证、建筑设计方案等材料，向县级以上城乡规划主管部门提出申请。主管部门将审查材料是否符合城乡规划要求，并作出是否批准的决定。
2. **咨询专业律师**：若对审批流程、所需材料或可能面临的法律风险有疑问，可咨询专业律师或法律顾问。律师将为您提供详细的法律建议，帮助您了解审批流程、准备必要材料，并评估可能面临的法律风险。
3. **应对审批结果**：若审批通过，您可按照批准的方案进行加层建设；若审批未通过，律师将协助您了解未通过的原因，并提供相应的法律建议，如修改设计方案、申请行政复议或提起行政诉讼等。在整个过程中，律师将确保您的合法权益得到充分保障。
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处理方式：
从法律角度，处理国有土地上建筑物加层问题，常见方式包括：
1. 向县级以上城乡规划主管部门申请加层审批，确保符合城乡规划要求。
2. 咨询专业律师或法律顾问，了解加层审批的具体流程、所需材料及可能面临的法律风险。
选择方式：
根据您的具体情况和需求，选择合适的处理方式。若对审批流程不熟悉，建议咨询专业律师或法律顾问，以确保合法合规。